Program Studi Sistem Komputer Undip juga aktif bekerja sama dengan Asosiasi Profesi dan Asosiasi Perguruan Tinggi sejenis. Dosen-Dosen di Program Studi Sistem Komputer aktif sebagai Member / Anggota dari Organisasi – Organisasi berikut :
- ACM (Association for Computer Machinery) – keanggotaan
- IEEE (Institute of Electrical and Electronics Engineer) – keanggotaan
- Council Member Indonesia Cisco Networking Academy – keanggotaan
- Aptikom ( Organisasi Perguruan Tinggi Komputer Indonesia)
- Student Branch IEEE – Siskom Undip
